Elle fut reconstruite en 1414 dans un style gothique flamboyant, puis agrandie entre 1485 et 15282.

En 1720, un clocher qui contenait à l'origine 10 cloches fut ajouté à l'édifice. En 1729, deux piliers s'effondrèrent entraînant la chute de la voûte du-dessus. En 1765, la foudre frappa le bâtiment, endommageant le clocher et brisant l'horloge.

Durant la Révolution française, l'église fut utilisée comme magasin de fourrage.

En 1874, l'église subit une restauration de style néo-gothique. L'orgue fut établi sur une tribune à l'entrée de la nef.

L'église fut protégée au titre des monuments historiques : classement par arrêté du 4 mars 1926.

Les bombardements du 20 mai 1940 abattirent une grande partie de l'église. Pendant la Seconde Guerre mondiale, Pierre Carpentier, prêtre de l'église Saint-Gilles et résistant, fut déporté à Bochum en 1942 et exécuté en 1943 à l'âge de 31 ans.